国家食用菌工程技术研究中心于2009年11月获批，组建期三年。按照国家工程技术研究中心有关管理办法要求，2013年8月1日科技部委托第三方在上海市农业科-太阳集团城网2018对本中心进行了现场验收评估，于2013年11月14日在北京进行了综合评议。

    近期，中心接到国科发计〔2014〕3号文，国家食用菌工程技术研究中心已完成了可行性论证报告和计划任务书要求的各项组建任务，完成了预期组建目标，具备了较强的科技成果产业化能力及辐射扩散能力，达到了验收标准，同意国家食用菌工程技术研究中心通过验收。

    科技部将每三年组织一次运行评估，运行评估优秀的，将以项目形式进行经费支持。此次验收不设立优秀组建单位。