科研进展|大麦SnRK家族基因鉴定及其对ABA的响应研究
近日,由我院生物技术研究所陆瑞菊研究员、刘成洪研究员领衔的“麦类作物高效育种技术创制及其应用”科研创新团队在生物学国际主流期刊BMC Genomics上发表了题为“Genome-wide identification of sucrose nonfermenting-1-related protein kinase (SnRK) genes in barley and RNA-seq analyses of their expression in response to ABA treatment”的研究论文。
蔗糖非发酵-1-相关蛋白激酶(SnRK),作为新陈代谢和生物或非生物胁迫信号途径的交叉感应器,有时候也涉及脱落酸(ABA)信号途径,在植物新陈代谢调控和生物或非生物胁迫反应中起着重要作用。因此,为应对气候变化的影响,研究作物SnRK将有助于培育抵抗各种生物或非生物胁迫的作物新品种。该基因家族在植物的进化中形成了三个亚家族,分别是SnRK1,SnRK2和SnRK3,后两个为植物中所特有。本研究中,团队人员首次在全基因组水平鉴定了大麦SnRK基因家族,利用生物信息学软件对其特性进行了分析和阐述,并利用转录组测序技术研究了其对于ABA处理的响应。该工作的完成,为进一步开展大麦青稞耐盐、耐低氮、抗白粉病等生物或非生物胁迫的分子机理研究提供了候选基因。
本文第一作者为陈志伟副研究员和周龙华博士,刘成洪研究员为本文通讯作者,英国洛桑研究院Nigel G. Halford教授(我院外籍客座研究员)作为最早开始系统研究植物SnRK的科学家之一也参与了相关工作。早在2012年,陈志伟作为访问学者在Nigel教授指导下完成了大麦SnRK基因在籽粒灌浆中作用的研究,并发表在国际期刊《Journal of Cereal Science》上,为本研究工作奠定了良好基础。本研究得到了上海市科技兴农重点攻关项目、上海市农科院卓越团队和科技支撑项目等资助。
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