本学科主要研究方向为分子细胞工程育种技术创新与应用、合成生物学、特色作物营养与功能技术创新与应用、转基因检测与安全评价技术创新与应用等。

建所以来承担了多项国家级、部市级重大科技项目，先后主持获得上海市科技进步（发明）奖项14项，其中一等奖5项、二等奖6项、三等奖3项；参与获得国家、部市级奖项10余项；发表学术论文400余篇，其中SCI论文近200篇；授权发明专利79项；品种审（认）定10份；8项转基因生物申报了我国农业部转基因生物安全性评审。

学科团队拥有国务院特殊津贴人才2人，国家百千万人才1人，上海市领军人才2人，上海市优秀学科带头人1人，上海市优秀技术带头人1人，国家大麦青稞产业技术体系遗传育种岗位科学家1人。